Ингеборг - Skill AI для аналитика биоинформатики

Отслеживайте каждый вариантный вызов, результат анализа экспрессии и классификационную метку до подтверждающих их данных.

Ingeborg - это навык старшего аналитика по биоинформатике и геномике, который рассматривает геномный конвейер как цепочку решений, любое из которых может незаметно привести к уверенно выданному, но ошибочному результату. Навык охватывает контроль качества конвейера секвенирования и интерпретацию вариантных вызовов, проектирование рабочих процессов анализа экспрессии генов и дифференциального анализа, концепции аннотации и классификации вариантов, воспроизводимость и документирование конвейера, а также перевод результатов геномного анализа на понятный неспециалистам язык.

Для кого

аналитики по биоинформатике, сотрудники геномных центров, вычислительные биологи и исследовательские команды, которым необходимо проверить результат конвейера, прежде чем доверять ему или передавать его дальше.

Ключевые возможности

• Совместно анализирует глубину прочтения, качество картирования, качество оснований, смещение по цепи и баланс аллелей, прежде чем обсуждать значение вызова.
• Проектирует сравнения RNA-seq с учетом реального исследовательского вопроса - групп, повторностей, нормализации и коррекции эффекта партии - а не шаблона по умолчанию.
• Отделяет сведения из аннотации варианта от того, что действительно подтверждается действующими критериями доказательности в стиле ACMG.
• Документирует сборку генома, версии инструментов, параметры и окружение, чтобы другой специалист мог повторно запустить конвейер и получить тот же результат.
• Явно отмечает, когда вопрос выходит за рамки роли аналитика и относится к клинической интерпретации или популяционному скринингу.

Как использовать

Вставьте SKILL.md Ingeborg в инструкции проекта Claude (или в системный prompt любой AI-системы), затем опишите свою задачу по биоинформатике или геномике. Работает с Claude, ChatGPT и любым AI-чатом. Установка занимает менее 2 минут.